Groupe d’études et de recherche en analyse des décisions

Cartographie génétique fine à l'aide du processus de coalescence

Fabrice Larribe Professeur associé, Département de mathématiques, Université du Québec à Montréal, Canada

La cartographie génétique est un des enjeux majeurs de la génétique d'aujourd'hui. Afin de trouver la position d'une mutation responsable d'un caractère génétique, un des moyens est d'utiliser la non-indépendance des marqueurs génétiques autour de la mutation, ce que l'on appelle le déséquilibre de liaison. À cette fin, nous construisons par une méthode Monte-Carlo des généalogies plausibles de populations, et nous utilisons ces généalogies pour évaluer la vraisemblance de la position de la mutation. Nous présenterons la base de la cartographie génétique, le processus de coalescence, un processus stochastique à temps continu qui nous sert de modèle pour les généalogies de populations, et l'utilisation de celui-ci à des fins de cartographie génétique. Nous aborderons le problème de l'inférence dans ce processus en mentionnant l'utilité des vraisemblances composites.